Сферы просто так разбросаны на уровнях, а также они выпадают из убитых врагов (в режиме с испытаниями тоже). Уже собранные на уровнях сферы заново не появляются, зато из врагов выпадать не перестают никогда, поэтому трофей вы получите при любом раскладе.